Mother følger den 38 år gamle Agnes gjennom syv avgjørende dager i Kolkata.

India. August 1948. Agnes, leder for Loreto-søstrenes kloster, drømmer om å gjøre en større forskjell. Drevet av et indre kall om å hjelpe verdens fattigste venter hun spent på et avgjørende brev fra pave Pius XII, som kan gi henne tillatelse til å forlate klosteret og grunnlegge sin egen orden. Men nettopp når drømmen synes å være innen rekkevidde, står hun overfor et skjebnesvangert valg som utfordrer hennes tro og lojalitet.

Hva er hun villig til å ofre for å føre sin misjon ut i livet - den som senere fører til at hun blir det ikonet verden i dag kjenner som Mor Teresa?